{"id":6629,"date":"2022-06-03T11:14:56","date_gmt":"2022-06-03T09:14:56","guid":{"rendered":"https:\/\/www.caribaea.org\/?p=6629"},"modified":"2022-06-03T11:14:56","modified_gmt":"2022-06-03T09:14:56","slug":"adn-sanguin-ou-salivaire-chez-les-oiseaux-la-methode-de-prelevement-importe","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.caribaea.org\/fr\/adn-sanguin-ou-salivaire-chez-les-oiseaux-la-methode-de-prelevement-importe\/","title":{"rendered":"ADN sanguin ou salivaire : Chez les oiseaux, la m\u00e9thode de pr\u00e9l\u00e8vement importe"},"content":{"rendered":"

Dans l\u2019\u00e9tude de bon nombre d\u2019esp\u00e8ces, les pr\u00e9l\u00e8vements d\u2019ADN permettent d\u2019obtenir des donn\u00e9es pr\u00e9cieuses. Chez les oiseaux, l\u2019ADN est souvent extrait \u00e0 partir de sang, une m\u00e9thode qui n\u00e9cessite une manipulation potentiellement stressante pour l\u2019animal. L\u2019ADN de la salive pourrait offrir un bon compromis dans certaines conditions, ainsi que le montre une comparaison des deux m\u00e9thodes chez une esp\u00e8ce sensible, le Pigeon \u00e0 couronne blanche. <\/strong><\/p>\n

L\u2019ADN contient une mine d\u2019informations pour les chercheurs. Il permet d\u2019avoir des donn\u00e9es vari\u00e9es, allant de l\u2019identit\u00e9 des individus (d\u00e9termination du sexe, de certains liens de parent\u00e9), \u00e0 des donn\u00e9es sur les populations enti\u00e8res (estimation de la taille des populations, de l\u2019importance des \u00e9changes de g\u00e8nes au sein de celles-ci). Les \u00e9tudes sur les populations d’oiseaux sauvages utilisent ainsi couramment des \u00e9chantillons d’ADN, obtenus \u00e0 partir d’une simple prise de sang. Les globules rouges des oiseaux, \u00e0 la diff\u00e9rence des n\u00f4tres, pr\u00e9sentent en effet l’avantage de poss\u00e9der un noyau riche en ADN, si bien qu’un \u00e9chantillon de sang de quelques microlitres suffit pour pratiquer de nombreuses analyses g\u00e9n\u00e9tiques. Toutefois, cette m\u00e9thode implique quelques contraintes\u00a0: elle impose un stress pour l\u2019animal, et n\u00e9cessite du mat\u00e9riel ad\u00e9quat permettant de conserver convenablement l\u2019ADN.<\/p>\n

\"\"Le pigeon \u00e0 couronne blanche (Patagioenas leucocephala<\/em>) est une esp\u00e8ce end\u00e9mique de la Cara\u00efbe et consid\u00e9r\u00e9e comme quasi-menac\u00e9e. Il est particuli\u00e8rement sensible \u00e0 la capture et \u00e0 la manipulation, qui induisent m\u00eame un \u00e9tat d\u2019immobilit\u00e9 tonique chez certains individus. D’o\u00f9 l’int\u00e9r\u00eat \u00e0 trouver une m\u00e9thode plus douce pour pr\u00e9lever de l\u2019ADN chez cette esp\u00e8ce. R\u00e9cemment, Christopher Cambrone et ses collaborateurs ont cherch\u00e9 \u00e0 \u00e9tablir dans quelle mesure un simple pr\u00e9l\u00e8vement de salive pourrait se substituer \u00e0 une prise de sang.<\/p>\n

A cette fin, 28 pigeons \u00e0 couronne blanche ont \u00e9t\u00e9 captur\u00e9s en R\u00e9publique Dominicaine afin de pr\u00e9lever sur un \u00e9chantillon de sang au niveau de la veine brachiale situ\u00e9e sous l’aile, et un pr\u00e9l\u00e8vement de salive, effectu\u00e9 en tournant pendant 10 secondes un b\u00e2tonnet garni d’une t\u00eate en mousse dans la bouche de l\u2019oiseau. Une fois les \u00e9chantillons ramen\u00e9s au laboratoire, l\u2019ADN a \u00e9t\u00e9 extrait et amplifi\u00e9 au niveau de deux s\u00e9quences de g\u00e8nes mitochondriaux, et deux amorces sp\u00e9cifiques des chromosomes sexuels ont \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9es afin d’identifier le sexe des individus.<\/p>\n

Si les chercheurs sont parvenus \u00e0 extraire avec succ\u00e8s l\u2019ADN de tous les \u00e9chantillons, sa qualit\u00e9 et sa quantit\u00e9 diff\u00e9raient selon la technique utilis\u00e9e. De mani\u00e8re attendue, une quantit\u00e9 d\u2019ADN plus importante a \u00e9t\u00e9 retrouv\u00e9e dans les \u00e9chantillons sanguins. Le succ\u00e8s d\u2019amplification \u00e9tait cependant le m\u00eame dans les deux m\u00e9thodes, en particulier lorsque la quantit\u00e9 d\u2019ADN issu des \u00e9chantillonnages salivaires \u00e9tait augment\u00e9e avant d\u2019\u00eatre amplifi\u00e9e. Le succ\u00e8s de l\u2019identification du sexe des individus \u00e9tait cependant d\u00e9pendant de la technique, passant de 100 % d\u2019identification pour les \u00e9chantillons d\u2019origine sanguine \u00e0 66 % pour ceux d\u2019origine salivaire. Une optimisation du protocole g\u00e9n\u00e9tique permettait toutefois d\u2019augmenter ce succ\u00e8s jusqu\u2019\u00e0 75%.<\/p>\n

Si l\u2019\u00e9tude confirme que le sang est un tissu de premier choix pour les analyses g\u00e9n\u00e9tiques, elle montre \u00e9galement que les \u00e9chantillons buccaux pourraient \u00eatre utilis\u00e9s dans certaines circonstances, puisqu\u2019ils permettent notamment le s\u00e9quen\u00e7age fiable de g\u00e8nes mitochondriaux allant jusqu\u2019\u00e0 une certaine taille. La quantit\u00e9 d\u2019ADN salivaire obtenue dans cette \u00e9tude \u00e9tait en outre sup\u00e9rieure \u00e0 celle qui est g\u00e9n\u00e9ralement obtenue en utilisant une troisi\u00e8me technique, celle d\u2019un pr\u00e9l\u00e8vement de plumes. L\u2019identification du sexe des individus par l\u2019ADN salivaire, bien qu\u2019ayant un taux de succ\u00e8s plus faible qu\u2019avec de l\u2019ADN sanguin, menait \u00e0 une conclusion syst\u00e9matiquement concordante entre les deux techniques.<\/p>\n

S\u2019il est plus efficace sur le plan g\u00e9n\u00e9tique, le pr\u00e9l\u00e8vement d\u2019ADN par le sang est aussi plus contraignant. Les risques d\u2019infection \u00e0 la suite d\u2019une ponction de la veine sont plus importants dans les milieux tropicaux, sans compter les risques de blessure dus \u00e0 la m\u00e9thode elle-m\u00eame. De plus, si les avis divergent quant au stress qu\u2019une prise de sang impose \u00e0 l\u2019animal, la m\u00e9thode requiert une manipulation plus longue de celui-ci, qui est elle-m\u00eame particuli\u00e8rement stressante pour certaines esp\u00e8ces sensibles, et notamment les plus jeunes individus. Enfin, pr\u00e9lever le sang impose un certain co\u00fbt et une certaine organisation sur le terrain et lors du transport, tandis que les \u00e9chantillons buccaux, qui se conservent secs, repr\u00e9sentent une m\u00e9thode accessible en toutes conditions. Certaines informations sur la physiologie, l\u2019\u00e9cologie ou la biologie des esp\u00e8ces (taux hormonaux, param\u00e8tres immunologiques, pr\u00e9sence de malarias aviaires, etc.) ne peuvent cependant \u00eatre obtenues qu’\u00e0 partir \u00e9chantillons sanguins.<\/p>\n

En d\u00e9finitive, le choix de la m\u00e9thode d\u2019\u00e9chantillonnage qui sera utilis\u00e9e r\u00e9sulte d\u2019une \u00e9valuation du meilleur ratio entre le besoin d\u2019informations et la contrainte impos\u00e9e par la m\u00e9thode, \u00e0 la fois pour les chercheurs et pour l\u2019animal. Les auteurs de l\u2019\u00e9tude sugg\u00e8rent d\u2019ailleurs un compromis dans le cas d\u2019\u00e9tudes prenant en compte un effectif important d\u2019individus, avec des \u00e9chantillonnages salivaires sur l\u2019ensemble de la population et des prises de sang uniquement sur certains individus choisis au hasard.<\/p>\n

 <\/p>\n

R\u00e9f\u00e9rence<\/strong><\/span><\/h5>\n

Cambrone, C<\/strong>., Motreuil, S., Reyes, F.O., Landestroy, M.A., C\u00e9zilly, F.<\/strong> & B\u00e9zault, E.<\/strong> (2022). Obtaining DNA samples from sensitive and endangered bird species: a comparison of saliva and blood samples. Ardeola, 69, 311-326.<\/p>\n

 <\/p>\n

A propos de l’auteur
\n<\/strong><\/span><\/h5>\n

Christopher Cambrone a suivi un master sp\u00e9cialis\u00e9 en \u00e9cologie comportementale \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 de Bourgogne Franche-Comt\u00e9 (Dijon) en terminant major de sa promotion. Il est l\u2019un des premiers \u00e9tudiants \u00e0 \u00eatre entr\u00e9 dans le programme Caribaea Initiative, d\u00e8s sa premi\u00e8re ann\u00e9e de master, durant laquelle il a initi\u00e9 ses travaux de recherche sur le pigeon \u00e0 couronne blanche et le pigeon \u00e0 cou rouge. Il a continu\u00e9 \u00e0 travailler sur la biologie et la g\u00e9n\u00e9tique des populations de ces deux esp\u00e8ces de pigeons durant son doctorat, \u00e9galement co-financ\u00e9 par Caribaea Initiative. Il est maintenant impliqu\u00e9 dans de nombreux projets de l\u2019association, en particulier le projet MERCI pour lequel il est le coordinateur scientifique en Guadeloupe.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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